超聲經顱多普勒血流分析儀與經顱磁刺激儀是不同的醫用設備，前者重在檢測，后者重在篩查。因此，它們的適用范圍也不相同，下面就來比較經顱多普勒與經顱磁刺激儀的適用范圍。

　　經顱多普勒的適用范圍如下：

　　1.腦血管疾病的檢查。如：高血壓及腦動脈硬化癥、腦血管狹窄和閉塞、腦血管痙攣、頭痛及偏頭痛、顱內動靜脈畸型、鎖骨下盜血等病癥的、疾病發展的觀察、指導藥物篩查、估計預后等。

　　2.腦血管機能的評價：腦血管外科術前術后的評價;腦血管復合操作的血流動力學評價;為腦血管造影術篩選病人和選擇造影時機。

　　3.危重病人的監護：腦血管病人手術前、中、后腦血流的監護;危重病人腦血管監護;

　　4.篩查保健：對中老年人的常規體檢，腦血管病的流行病學調查，對腦血管病高危人群建立檔案和進行中風預測。

　　5.微血栓的檢測。

　　6.其他基礎研究：對腦血管疾病的演變過程、發病機理和病因控制的研究;藥物對腦血管的作用及腦血流的影響;不同狀況下腦血流狀況。

　　經顱磁刺激儀的適應癥(參考病癥)如下：

　　1.腦缺血性疾病：腦血栓形成、腔隙性梗塞、血管性癡呆、腦供血不足、小兒腦癱、腦動脈硬化、癲癇病等。

　　2.腦損傷性疾病：腦震蕩、腦挫裂傷及腦外傷后遺癥、腦出血恢復期、腦缺氧性傷害、腦中毒性損傷。

　　3.神經系統疾病：偏頭痛、神經癥、失眠、認知功能障礙、老年癡呆、腦萎縮、抑郁癥、腦疲勞綜合癥。

　　4.兒童 病癥：運動、姿勢、語言、智力、視聽覺、生長發育、牙齒發育、情緒和行為障礙