正確的手法與探頭位置是經顱多普勒(TCD檢查成功的關鍵，直接影響信號質量與結果可靠性。主要聲窗及操作手法如下：

顳窗：位于耳廓前上方顳骨鱗部，是探測大腦中動脈、大腦前動脈和大腦后動脈常用的聲窗。操作時檢測者平臥或側臥，探頭輕觸皮膚，指向中線稍偏上的方向，深度一般在45–65mm之間，細微調整角度以獲取清晰頻譜;

枕窗：位于枕外粗隆下方，頭稍前傾使頸部屈曲，經枕骨大孔探測基底動脈和椎動脈。探頭置于中線附近，指向眉間方向，深度通常需70–120mm，注意避免過度按壓;

眼窗：閉合眼瞼上，經眶上裂探測眼動脈和頸內動脈虹吸段。操作需嚴格使用低功率輸出(≤10%)，縮短檢查時間，避免熱效應。探頭輕置眼瞼，指向后方或稍向內，深度一般在50–80mm;

下頜窗：位于下頜角下方，用于探測頸內動脈顱外段。檢測者頭稍轉向對側，探頭指向耳廓前上方，深度約40–60mm，輔助判斷血流方向與速度。

操作中需保持探頭穩定，耦合充分，通過細微旋轉和傾斜調整角度，依據多普勒音頻和頻譜形態判斷血管識別是否正確。全程應避免用力壓迫，尤其眼窗操作需格外謹慎。